Клиническая метаболомика представляет собой междисциплинарное направление, изучающее маломолекулярные метаболиты в биологических жидкостях, преимущественно в таких, как кровь и моча. Основная цель этой науки — выявление биомаркеров, которые помогают диагностировать, прогнозировать и отслеживать течение различных заболеваний. Фармакометаболомика, основанная на принципах клинической метаболомики, играет важную роль в исследовании и оценке эффективности и безопасности лекарственных препаратов на метаболические пути и персонализации терапии.